Музей Шістдесятництва був створений з ініціативи однойменної неурядової організації. Ідея була наочно втілена двома українськими політичними в’язнями Надією Світличною та Миколою Плахотнюком, які у 1970-х і 1980-х роках відбували довготермінові покарання. Більшість архівних колекцій музею складають приватні матеріали та документи українських шістдесятників, які були зібрані в Україні та на еміграції. На постійній виставці представлені твори талановитих художників, скульпторів, графічних дизайнерів, художників, літературознавців, поетів та інших митців, які були учасниками руху шістдесятників в Україні.
У музеї зберігаються написані та опубліковані шістдесятниками самвидави, чималі бібліотечні збірки творів українських та зарубіжних авторів, рукописи, унікальні фотографії активістів 60-х років, а також артефакти, вироби ручної роботи та предмети щоденного вжитку, виконані в’язнями трудових таборів Сибіру. Загалом колекція постійно збільшується. На даний час вона нараховує понад 30000 музейних одиниць.
